Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	GEX2	YKR106W	1848 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	GUD1	YDL238C	1470 nt		5.83	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	MRPL35	YDR322W	1104 nt		5.82	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	GCG1	YER163C	699 nt		5.82	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	BCY1	YIL033C	1251 nt		5.82	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	FSF1	YOR271C	984 nt		5.82	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	VTC2	YFL004W	2487 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	YKR045C	YKR045C	552 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	TAL1	YLR354C	1008 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	SAL1	YNL083W	1485 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	PLB3	YOL011W	2061 nt		5.81	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	ERG8	YMR220W	1356 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	ERG7	YHR072W	2196 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	CYS4	YGR155W	1524 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	IME2	YJL106W	1938 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	VCX1	YDL128W	1236 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	RPN11	YFR004W	921 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	YPL041C	YPL041C	624 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	ATP1	YBL099W	1638 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	ALT1	YLR089C	1779 nt		5.8	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	YDL023C	YDL023C	321 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	YJL193W	YJL193W	1209 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	RPN7	YPR108W	1290 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	KKQ8	YKL168C	2175 nt		5.79	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	WHI2	YOR043W	1461 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	MNN2	YBR015C	1794 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	YKL153W	YKL153W	510 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	TSR2	YLR435W	618 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	YNL108C	YNL108C	813 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	DDC1	YPL194W	1839 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	ZWF1	YNL241C	1518 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	ISN1	YOR155C	1353 nt		5.78	□□□□□ -1.48
VIK1	Q12045	UIP5	YKR044W	1332 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	RAD59	YDL059C	717 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	SIP2	YGL208W	1248 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	YNR040W	YNR040W	771 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	ERI1	YPL096C-A	207 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	FRS2	YFL022C	1512 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	CST6	YIL036W	1764 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	HSP78	YDR258C	2436 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	VMS1	YDR049W	1899 nt		5.77	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	HST3	YOR025W	1344 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	IDP1	YDL066W	1287 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	YDR396W	YDR396W	501 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	AAT2	YLR027C	1257 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	PUS4	YNL292W	1212 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	RRS1	YOR294W	612 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	SGF29	YCL010C	780 nt		5.76	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	OXP1	YKL215C	3861 nt		5.75	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	ASH1	YKL185W	1767 nt		5.75	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	YEH1	YLL012W	1722 nt		5.75	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	MDH3	YDL078C	1032 nt		5.75	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	COX17	YLL009C	210 nt		5.75	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	TSA1	YML028W	591 nt		5.75	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	GLC8	YMR311C	690 nt		5.75	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	ENT2	YLR206W	1842 nt		5.75	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	ECM14	YHR132C	1293 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	URA1	YKL216W	945 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	YHM2	YMR241W	945 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	SCS7	YMR272C	1155 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	YBR027C	YBR027C	333 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	RPO26	YPR187W	468 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	TAH18	YPR048W	1872 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	SSK1	YLR006C	2139 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	CLP1	YOR250C	1338 nt		5.74	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	RFA1	YAR007C	1866 nt		5.73	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	VBA1	YMR088C	1689 nt		5.73	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	MPM1	YJL066C	759 nt		5.73	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	RAD3	YER171W	2337 nt		5.73	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	NHA1	YLR138W	2958 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	SDH4	YDR178W	546 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	tR(ACG)D	tR(ACG)D	73 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	tR(ACG)E	tR(ACG)E	73 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	tR(ACG)K	tR(ACG)K	73 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	tR(ACG)L	tR(ACG)L	73 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	tR(ACG)O	tR(ACG)O	73 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	SMF2	YHR050W	1650 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	YAP1801	YHR161C	1914 nt		5.72	□□□□□ -1.49
VIK1	Q12045	MAL11	YGR289C	1851 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	PYC1	YGL062W	3537 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	HSF1	YGL073W	2502 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YDL057W	YDL057W	987 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YEL068C	YEL068C	333 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YER148W-A	YER148W-A	579 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	LDS1	YAL018C	978 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YJU3	YKL094W	942 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	FLC3	YGL139W	2409 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	VTH1	YIL173W	4650 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	VTH2	YJL222W	4650 nt		5.71	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	RNR3	YIL066C	2610 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	TRP1	YDR007W	675 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YIL029W-A	YIL029W-A	372 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YLR317W	YLR317W	435 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	CCZ1	YBR131W	2115 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	ILV6	YCL009C	930 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	CRF1	YDR223W	1404 nt		5.7	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	RET1	YOR207C	3450 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	ASF2	YDL197C	1578 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	EIS1	YMR031C	2532 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YDR053W	YDR053W	396 nt		5.69	□□□□□ -1.5

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