Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.813e-8■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 ZNF277-202ENST00000361946 1736 ntTSL 1 (best)24.81■■□□□ 1.561e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 ZNF277-207ENST00000457808 891 ntTSL 523.98■■□□□ 1.431e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 ZNF277-205ENST00000425229 617 ntTSL 321.24■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 ZNF277-206ENST00000450657 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 ZNF277-203ENST00000421043 2218 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 PTK2-203ENST00000430260 1940 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 PTK2-238ENST00000521986 2393 ntTSL 211.4□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 PTK2-246ENST00000523539 3236 ntTSL 210.33□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-221ENST00000452492 581 ntTSL 329.22■■■□□ 2.272e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-203ENST00000414318 2088 ntTSL 525.34■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 421.09■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 321.09■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-207ENST00000425944 591 ntTSL 420.2■□□□□ 0.822e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-218ENST00000445294 623 ntTSL 220.02■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-204ENST00000414349 687 ntTSL 319.1■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 516.8■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-202ENST00000412981 592 ntTSL 316.8■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-208ENST00000428355 757 ntTSL 316.33■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 315.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 315.56■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 314.71□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-220ENST00000446863 557 ntTSL 414.08□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 49.95□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-214ENST00000443386 561 ntTSL 49.95□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-230ENST00000507877 578 ntTSL 46.73□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TBC1D5-212ENST00000433533 471 ntTSL 34.07□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.983e-16■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)24.21■■□□□ 1.472e-8■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 SMAP2-203ENST00000435168 666 ntTSL 59.73□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TTC7B-202ENST00000553948 630 ntTSL 551.52■■■■■ 5.846e-8■■■■■ 34
HNRNPMP52272 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.96e-8■■■■■ 34
HNRNPMP52272 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 225.27■■□□□ 1.647e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.327e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 PICALM-216ENST00000531771 631 ntTSL 35.6□□□□□ -1.518e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.13e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.853e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.263e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.033e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.437e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.727e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.987e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.037e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.067e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.194e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.729e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.842e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.772e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.422e-7■■■■■ 34
HNRNPMP52272 USP15-213ENST00000549268 1087 ntTSL 56.2□□□□□ -1.423e-7■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 USP15-207ENST00000547317 499 ntTSL 35.85□□□□□ -1.473e-7■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.499e-7■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 515.76■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.699e-7■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 PCBD2-203ENST00000510013 361 ntTSL 55□□□□□ -1.619e-7■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 AC007388.1-203ENST00000422128 596 ntTSL 432.82■■■□□ 2.843e-7■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 AC007388.1-207ENST00000446698 593 ntTSL 519.66■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.136e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 TNRC6B-204ENST00000441751 415 ntTSL 524.28■■□□□ 1.486e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.336e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.946e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.726e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.596e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.496e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 BMF-203ENST00000431415 492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.396e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 BMF-210ENST00000561360 735 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.086e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 BMF-202ENST00000397573 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.26e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.446e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 FOXN2-202ENST00000413569 932 ntTSL 322.45■■□□□ 1.182e-8■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 CFI-207ENST00000618244 1345 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 ZDHHC21-201ENST00000380916 9160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.077e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 SEC14L1-219ENST00000588616 578 ntTSL 47.7□□□□□ -1.187e-10■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 ATL2-213ENST00000474535 597 ntTSL 33.77□□□□□ -1.811e-8■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 ARVCF-207ENST00000473551 2108 ntTSL 227.91■■■□□ 2.061e-8■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.071e-8■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.971e-8■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.81e-8■■■■■ 33.9
HNRNPMP52272 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.156e-7■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 522.17■■□□□ 1.146e-7■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 EVPL-203ENST00000587569 6592 ntTSL 219.69■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 229.45■■■□□ 2.313e-7■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.155e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.515e-8■■■■■ 33.8
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 385.5 ms