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Protein–RNA interactions for Protein: P47050
RTT101, Cullin-8, yeast
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842 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTT101
P47050
ISN1
YOR155C
1353 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
ATG22
YCL038C
1587 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
COX9
YDL067C
180 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
tR(ACG)D
tR(ACG)D
73 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
tR(ACG)E
tR(ACG)E
73 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
tR(ACG)K
tR(ACG)K
73 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
tR(ACG)L
tR(ACG)L
73 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
tR(ACG)O
tR(ACG)O
73 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
SPO7
YAL009W
780 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
ICT1
YLR099C
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6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
ARA2
YMR041C
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6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
REC114
YMR133W
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□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
ESC8
YOL017W
2145 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
KKQ8
YKL168C
2175 nt
6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
COR1
YBL045C
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6.06
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
AFG1
YEL052W
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□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
IDP3
YNL009W
1263 nt
6.05
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
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YDL022C-A
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6.04
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
YDL172C
YDL172C
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6.04
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
SYF2
YGR129W
648 nt
6.04
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
ERP5
YHR110W
639 nt
6.04
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
OAC1
YKL120W
975 nt
6.04
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
AAD15
YOL165C
432 nt
6.04
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
DAP1
YPL170W
459 nt
6.04
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
YHL017W
YHL017W
1599 nt
6.04
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
KTR5
YNL029C
1569 nt
6.04
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
RSA4
YCR072C
1548 nt
6.04
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
YFR006W
YFR006W
1608 nt
6.03
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
TEP1
YNL128W
1305 nt
6.03
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
YDL144C
YDL144C
1071 nt
6.03
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
snR82
snR82
268 nt
6.03
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
PHB1
YGR132C
864 nt
6.03
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
BNS1
YGR230W
414 nt
6.03
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
GLN1
YPR035W
1113 nt
6.03
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
ATG12
YBR217W
561 nt
6.03
□□□□□ -1.44
RTT101
P47050
HIS7
YBR248C
1659 nt
6.02
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
GFA1
YKL104C
2154 nt
6.02
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
TOM20
YGR082W
552 nt
6.02
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
YML083C
YML083C
1257 nt
6.02
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
YNL165W
YNL165W
1221 nt
6.02
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
UBC11
YOR339C
471 nt
6.02
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
MRK1
YDL079C
1506 nt
6.02
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
PET112
YBL080C
1626 nt
6.02
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
MTF2
YDL044C
1323 nt
6.01
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
PRP24
YMR268C
1335 nt
6.01
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
EFM3
YJR129C
1020 nt
6.01
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
ATP4
YPL078C
735 nt
6.01
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
YPR123C
YPR123C
435 nt
6.01
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
POP1
YNL221C
2628 nt
6
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
YOL036W
YOL036W
2286 nt
6
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
RMA1
YKL132C
1293 nt
6
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
CSL4
YNL232W
879 nt
6
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
IFA38
YBR159W
1044 nt
6
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
MCM3
YEL032W
2916 nt
6
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
KEL1
YHR158C
3495 nt
6
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
HXT17
YNR072W
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□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
CIT3
YPR001W
1461 nt
5.99
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
PGK1
YCR012W
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5.99
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
SUP19
tS(UGA)E
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5.99
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
SUP17
tS(UGA)I
82 nt
5.99
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RTT101
P47050
SUP16
tS(UGA)P
82 nt
5.99
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RTT101
P47050
EHD3
YDR036C
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RTT101
P47050
ALT2
YDR111C
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RTT101
P47050
FRS2
YFL022C
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RTT101
P47050
PUF3
YLL013C
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□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
ATG17
YLR423C
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□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
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YNL067W-A
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5.98
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
MRS1
YIR021W
1092 nt
5.97
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
SNO4
YMR322C
714 nt
5.97
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
HSP33
YOR391C
714 nt
5.97
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
HSP32
YPL280W
714 nt
5.97
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
YBR144C
YBR144C
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5.97
□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
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YCL061C
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□□□□□ -1.45
RTT101
P47050
VPS5
YOR069W
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RTT101
P47050
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YGR065C
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RTT101
P47050
SHO1
YER118C
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5.96
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RTT101
P47050
YOL163W
YOL163W
510 nt
5.96
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RTT101
P47050
CNE1
YAL058W
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5.95
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
YFL042C
YFL042C
2025 nt
5.95
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
RPN11
YFR004W
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5.95
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RTT101
P47050
MTC2
YKL098W
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□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
CCP1
YKR066C
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5.95
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
RPN7
YPR108W
1290 nt
5.95
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
MNN5
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RTT101
P47050
MTC5
YDR128W
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RTT101
P47050
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YHR056C
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5.94
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
ATF1
YOR377W
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□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
MDH3
YDL078C
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□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
YGR127W
YGR127W
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5.94
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
DJP1
YIR004W
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□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
YNR040W
YNR040W
771 nt
5.94
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
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YMR290C
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RTT101
P47050
CBP4
YGR174C
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□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
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YBR050C
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P47050
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YGL253W
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RTT101
P47050
APE3
YBR286W
1614 nt
5.92
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
YDL119C
YDL119C
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5.92
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
SUP2
tY(GUA)D
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5.92
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
SUP11
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75 nt
5.92
□□□□□ -1.46
RTT101
P47050
SUP6
tY(GUA)F2
75 nt
5.92
□□□□□ -1.46
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