Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL5P42830 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms