Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFKBIAP25963 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms