Protein–RNA interactions for Protein: P0CX23

RPL20A, 60S ribosomal protein L20-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL20AP0CX23 ELP3YPL086C 1674 nt5.46□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 PRI2YKL045W 1587 nt5.46□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 TEP1YNL128W 1305 nt5.46□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 JIP4YDR475C 2631 nt5.45□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 TFC6YDR362C 2019 nt5.45□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 GPA2YER020W 1350 nt5.45□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 ATG23YLR431C 1362 nt5.45□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 GUF1YLR289W 1938 nt5.45□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 ACO1YLR304C 2337 nt5.45□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 YLR126CYLR126C 756 nt5.45□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 SLD7YOR060C 774 nt5.45□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 SCO2YBR024W 906 nt5.45□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 ATG4YNL223W 1485 nt5.45□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 KNS1YLL019C 2214 nt5.44□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 PRS2YER099C 957 nt5.44□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 YHL017WYHL017W 1599 nt5.44□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 REV7YIL139C 738 nt5.44□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 SEN34YAR008W 828 nt5.44□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 MRPS12YNR036C 462 nt5.44□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 MRPS5YBR251W 924 nt5.44□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 HXT17YNR072W 1695 nt5.43□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 HOS2YGL194C 1359 nt5.43□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 PGK1YCR012W 1251 nt5.43□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 UGX2YDL169C 672 nt5.43□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 PHB1YGR132C 864 nt5.43□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 ERP2YAL007C 648 nt5.43□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 IRS4YKR019C 1848 nt5.43□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 FRS2YFL022C 1512 nt5.43□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 PAP2YOL115W 1755 nt5.42□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 COS6YGR295C 1146 nt5.42□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.42□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 AST1YBL069W 1290 nt5.42□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 OCA1YNL099C 717 nt5.42□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 YOR200WYOR200W 399 nt5.42□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 YPL102CYPL102C 303 nt5.42□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 TPO3YPR156C 1869 nt5.42□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 PRP24YMR268C 1335 nt5.42□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 YOL036WYOL036W 2286 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 GPB2YAL056W 2643 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 DFM1YDR411C 1026 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 CIS3YJL158C 684 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 EFM3YJR129C 1020 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 GLN1YPR035W 1113 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 AFG1YEL052W 1530 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 CNE1YAL058W 1509 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 MSS1YMR023C 1581 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 PXL1YKR090W 2121 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 COR1YBL045C 1374 nt5.41□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.4□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 SPO7YAL009W 780 nt5.4□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 ICT1YLR099C 1185 nt5.4□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 YOL163WYOL163W 510 nt5.4□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 UBC11YOR339C 471 nt5.4□□□□□ -1.54
RPL20AP0CX23 IME2YJL106W 1938 nt5.4□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SIR2YDL042C 1689 nt5.4□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 IMA5YJL216C 1746 nt5.4□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 MNN5YJL186W 1761 nt5.39□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SLX5YDL013W 1860 nt5.39□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 ASK1YKL052C 879 nt5.39□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 YMR147WYMR147W 672 nt5.39□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SHP1YBL058W 1272 nt5.39□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 YPL071CYPL071C 471 nt5.39□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 OPT1YJL212C 2400 nt5.39□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 ISN1YOR155C 1353 nt5.39□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 RPN11YFR004W 921 nt5.38□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.38□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.38□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.38□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 YPR123CYPR123C 435 nt5.38□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 IFA38YBR159W 1044 nt5.38□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 ATG12YBR217W 561 nt5.38□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 ERG12YMR208W 1332 nt5.38□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 MCM3YEL032W 2916 nt5.37□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 HIS7YBR248C 1659 nt5.37□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 MRS1YIR021W 1092 nt5.37□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SNN1YNL086W 309 nt5.37□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 AVT4YNL101W 2142 nt5.37□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 YNR040WYNR040W 771 nt5.37□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 TFB4YPR056W 1017 nt5.37□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 ECM30YLR436C 3825 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 YML6YML025C 861 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 AAD15YOL165C 432 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 APM1YPL259C 1428 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 ENP1YBR247C 1452 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 MRK1YDL079C 1506 nt5.36□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 RSC2YLR357W 2670 nt5.35□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 YDL023CYDL023C 321 nt5.35□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 YNL200CYNL200C 741 nt5.35□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 HST2YPL015C 1074 nt5.35□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 YBR144CYBR144C 315 nt5.35□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 COX9YDL067C 180 nt5.34□□□□□ -1.55
RPL20AP0CX23 YDR401WYDR401W 564 nt5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms