Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM200CA6NKL6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms