Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms