Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms