Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms