Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms