Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms