Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FRMD7Q6ZUT3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms