Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC174Q6PII3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC174Q6PII3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms