Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLIPQ5VWP3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLIPQ5VWP3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms