Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FAM46CQ5VWP2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM46CQ5VWP2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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