Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM16LQ309B1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM16LQ309B1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms