Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP7Q16576 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms