Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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PCSK7Q16549 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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PCSK7Q16549 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PCSK7Q16549 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PCSK7Q16549 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PCSK7Q16549 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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