Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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