Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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