Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEUP1Q05D60 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms