Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC110015.1-201ENST00000423367 440 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNP2Q05952 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms