Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms