Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms