Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB28P51157 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms