Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP153P49790 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP153P49790 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP153P49790 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP153P49790 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP153P49790 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms