Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561P49447 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561P49447 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYB561P49447 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms