Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NESP48681 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NESP48681 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NESP48681 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NESP48681 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NESP48681 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms