Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MLH1P40692 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MLH1P40692 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MLH1P40692 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MLH1P40692 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MLH1P40692 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MLH1P40692 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MLH1P40692 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MLH1P40692 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MLH1P40692 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MLH1P40692 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MLH1P40692 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MLH1P40692 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MLH1P40692 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MLH1P40692 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms