Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC1P35052 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms