Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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HOXA13P31271 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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HOXA13P31271 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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HOXA13P31271 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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HOXA13P31271 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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HOXA13P31271 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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HOXA13P31271 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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HOXA13P31271 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA13P31271 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms