Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI2P10070 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI2P10070 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI2P10070 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI2P10070 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLI2P10070 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI2P10070 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI2P10070 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms