Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCP02774 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCP02774 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCP02774 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCP02774 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCP02774 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCP02774 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCP02774 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCP02774 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCP02774 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCP02774 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCP02774 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCP02774 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms