Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPLNO95428 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms