Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF4O60810 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms