Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRTO14522 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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