Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms