Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms