Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGSF9BQ9UPX0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms