Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK1Q9UPV9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms