Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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