Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REREQ9P2R6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms