Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms