Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms