Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms