Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFPL4BQ6ZWI9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFPL4BQ6ZWI9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms