Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SAMD13Q5VXD3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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SAMD13Q5VXD3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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