Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF8Q5VWM4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms