Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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